<div>Hi,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I'm trying to extract the outer surface of a brain volume data. I tried both vtkDataSetSurfaceFilter and vtkImageMarchingCubes&nbsp;(marching&nbsp;cubes algorithm&nbsp;goes&nbsp;after thresholding and smoothing). However, neither of them give the correct surface.
</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>vtkDataSetSurfaceFilter will only give the volume bounding box surface&nbsp;-- well in some sense it&nbsp;IS the outer surface, just too out. Result remains the same after thresholding.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>vtkImageMarchingCubes gives a nice surface, but only the lower 1/4 part of the volume. I read the vtkImageMarchingCubes&nbsp;documentation, but have no clue why this would happen.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>The data set is converted from ITK and&nbsp;should be&nbsp;okay. I&nbsp;manually constructed it and got the same error.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I would appreciate any help.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>- xin</div>