i found it.<br><br>Linking CXX executable ../../bin/VTKJavaExecutable<br>/usr/bin/ld: warning: libmawt.so, needed by /usr/lib/jvm/java-6-sun/jre/lib/i386/libjawt.so, not found (try using -rpath or -rpath-link)<br>/usr/lib/jvm/java-6-sun/jre/lib/i386/libjawt.so: undefined reference to `awt_GetDrawingSurface@SUNWprivate_1.1&#39;<br>
/usr/lib/jvm/java-6-sun/jre/lib/i386/libjawt.so: undefined reference to `awt_FreeDrawingSurface@SUNWprivate_1.1&#39;<br>/usr/lib/jvm/java-6-sun/jre/lib/i386/libjawt.so: undefined reference to `awt_GetComponent@SUNWprivate_1.1&#39;<br>
/usr/lib/jvm/java-6-sun/jre/lib/i386/libjawt.so: undefined reference to `awt_Lock@SUNWprivate_1.1&#39;<br>/usr/lib/jvm/java-6-sun/jre/lib/i386/libjawt.so: undefined reference to `awt_Unlock@SUNWprivate_1.1&#39;<br>collect2: ld returned 1 exit status<br>
make[2]: *** [bin/VTKJavaExecutable] Error 1<br>make[1]: *** [Wrapping/Java/CMakeFiles/VTKJavaExecutable.dir/all] Error 2<br>make: *** [all] Error 2<br><br>seems i&#39;m not the first person to get here:<br>this guy: <a href="http://public.kitware.com/pipermail/vtkusers/2003-November/070622.html">http://public.kitware.com/pipermail/vtkusers/2003-November/070622.html</a> <br>
had the same problem but not sure if he ever fixed it. <br><br>I dont know why make can&#39;t find libmawt.so it&#39;s there in the motif21 sub-dir. Though ii seemed a bit dodgy i copied that .so up one dir so it was in the same ../jre/lib dir as libjawt.so and:<br>
<br>[100%] Building CXX object Widgets/Testing/Cxx/CMakeFiles/WidgetsCxxTests.dir/TestImageTracerWidget.o <br>Linking CXX executable ../../../bin/WidgetsCxxTests<br>[100%] Built target WidgetsCxxTests<br><br>great!!!<br><br>
i wonder why libmawt wasn&#39;t found. There was a JAVA_JVM_LIBRARY option that wasn&#39;t set... maybe it was to do with that... i&#39;m not everyone who tries to compile vtk on linux has this problem. <br><br>well, i never imagined it would take day to compile vtk but hey now i can start using it.<br>
<br>thanks for you help.<br><br><br>If anyone has any good references for using the java wrapper people let me know,<br><br>Liam<br><br><br><br><br><br><br><br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Apr 18, 2008 at 5:36 PM, David Gobbi &lt;<a href="mailto:david.gobbi@gmail.com">david.gobbi@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">All of those java library and header items must be set or the compile will fail.<br>
<br>
E.g. for awt, give the full path to &quot;libjawt.so&quot;.<br>
<br>
You&#39;ll just have to search through your java installation to find each<br>
item. &nbsp;On Ubuntu, /usr/lib/jvm is where to start looking.<br>
<br>
I don&#39;t know of any documentation on this.<br>
<font color="#888888"><br>
 &nbsp; David<br>
</font><div><div></div><div class="Wj3C7c"><br>
<br>
<br>
On Fri, Apr 18, 2008 at 12:27 PM, Liam K &lt;<a href="mailto:quantum.leaf@googlemail.com">quantum.leaf@googlemail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt; so close....<br>
&gt;<br>
&gt; [ 97%] Building CXX object<br>
&gt; Wrapping/Java/CMakeFiles/VTKJavaExecutable.dir/VTKJava.o<br>
&gt; Linking CXX executable ../../bin/VTKJavaExecutable<br>
&gt; /usr/local/VTK/bin/libvtkRenderingJava.so: undefined reference to<br>
&gt; `JAWT_GetAWT&#39;<br>
&gt; &nbsp;collect2: ld returned 1 exit status<br>
&gt; make[2]: *** [bin/VTKJavaExecutable] Error 1<br>
&gt; make[1]: *** [Wrapping/Java/CMakeFiles/VTKJavaExecutable.dir/all] Error 2<br>
&gt; make: *** [all] Error 2<br>
&gt;<br>
&gt; i&#39;m wondering if this is to due with the cmake option JAVA_AWT_LIBRARY not<br>
&gt; being set. I&#39;m sure ive got it somewhere in the jdk but i&#39;m not sure what<br>
&gt; the option once. Is there documentation somewhere which says what each<br>
&gt; option needs to point to?<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; Liam<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; ps:&gt; i mean to send the msg below to the whole list, but just hit reply<br>
&gt; without thinking:<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; On Fri, Apr 18, 2008 at 5:20 PM, Liam K &lt;<a href="mailto:quantum.leaf@googlemail.com">quantum.leaf@googlemail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt;<br>
&gt; &gt; Thanks David,<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; So far so good. It&#39;s compiling at 50%.<br>
&gt; &gt; Seems the problem was some missing packages.<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; I&#39;d like to know how i was supposed to know i would need them, I wonder if<br>
&gt; i&#39;ve missed a key bit of documentation. Isnt it cmakes job to make sure<br>
&gt; everything is available before make starts?<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; anyway, hopefully it&#39;s working now,<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; thanks for your help,<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; Liam<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; On Fri, Apr 18, 2008 at 4:50 PM, David Gobbi &lt;<a href="mailto:david.gobbi@gmail.com">david.gobbi@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt; wrote:<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; You should not need any special compiler flags. &nbsp;It is more likely<br>
&gt; &gt; &gt; that you are missing some important dev packages. &nbsp;I have ubuntu 6.06,<br>
&gt; &gt; &gt; so the version numbers might be different for you, but make sure you<br>
&gt; &gt; &gt; have these or the equivalents:<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; libstdc++6-4.0-dev<br>
&gt; &gt; &gt; libc6-dev<br>
&gt; &gt; &gt; libX11-dev<br>
&gt; &gt; &gt; libgl1-mesa-dev<br>
&gt; &gt; &gt; libglu1-mesa-dev<br>
&gt; &gt; &gt; tcl8.4-dev<br>
&gt; &gt; &gt; tk8.4-dev<br>
&gt; &gt; &gt; sun-java6-jdk<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; After installing these you should delete your old CMakeCache.txt (or<br>
&gt; &gt; &gt; even the whole VTK binary directory, to be safe) so that the cmake<br>
&gt; &gt; &gt; autodetection will properly catch all the header files that VTK uses.<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; Note that when you get to the java stage, cmake will not automatically<br>
&gt; &gt; &gt; find the java headers or libraries. &nbsp;You will have to enter all the<br>
&gt; &gt; &gt; java related CMake flags manually under &quot;advanced&quot;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &nbsp; David<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; On Fri, Apr 18, 2008 at 11:29 AM, Liam K &lt;<a href="mailto:quantum.leaf@googlemail.com">quantum.leaf@googlemail.com</a>&gt;<br>
&gt; wrote:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; (sorry for previous blank post)<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; Hi,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; Thanks for the replies.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; Indeed, i am hoping to use VTK with the java wrappers, but at the<br>
&gt; moment the<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; problem i&#39;m having is compiling the binaries. I get the same errors<br>
&gt; even if<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; i disable to java wrapper option in cmake.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;I&#39;m sure this must be a compiler flag option or something similar...<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; Liam<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; On Fri, Apr 18, 2008 at 4:28 PM, Liam K &lt;<a href="mailto:quantum.leaf@googlemail.com">quantum.leaf@googlemail.com</a>&gt;<br>
&gt; wrote:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; On Fri, Apr 18, 2008 at 3:17 PM, David Gobbi &lt;<a href="mailto:david.gobbi@gmail.com">david.gobbi@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; wrote:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; AFAIK the debian distribution of VTK does not come with java<br>
&gt; support,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; so switching away from Ubuntu is not going to help Liam at all.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Ubuntu may not come with VTK binaries, but it has all of the VTK<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; dependencies. &nbsp;Liam will have to install all of the sun-java6<br>
&gt; packages<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; as well as cmake and the dev packages for tcl, tk, etc. but the<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; process should be straightforward once all the dev packages are<br>
&gt; there.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Anyone out there with experience specifically in installing<br>
&gt; VTK-java<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; on ubuntu? &nbsp;The last time that I did it was a couple years ago, so<br>
&gt; I&#39;m<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; a little rusty.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp; David<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; On Fri, Apr 18, 2008 at 10:00 AM, Oleksandr Dzyubak<br>
&gt; &lt;<a href="mailto:adzyubak@gmail.com">adzyubak@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; wrote:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Hi Liam,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;Ubuntu is based on and derived from Debian.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;Since you are using Ubuntu anyway, &nbsp;I would recommend you<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;to install Debian Lenny on your Linux box.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;Lenny has Cmake, Make, ITK, &nbsp;VTK, &nbsp;wxWidgets, FLTK, QT(3/4),<br>
&gt; Perl,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; Tcl/Tk<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;and all what you might need for your development in their<br>
&gt; repository<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; as<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;binary pre-built packages thus it works right out of the box.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;Since you are Ubuntu (meaning Debian) user<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;you know how to install needed packages and satisfy all<br>
&gt; dependencies.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;The good thing is that if you do that, it will save you a lot<br>
&gt; of time<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; and<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; efforts<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;you might spent on first compiling the distribution packages<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; themselves,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;latter examples, and finally &quot;dependency hell&quot; when you will<br>
&gt; start<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;&quot;putting all together&quot; in your own application.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;Hope it helps,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;Alex<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &nbsp;Liam K wrote:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Hi,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; I&#39;m looking for some help in compiling VTK+. I&#39;m hoping to use<br>
&gt; it<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; with the<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; java wrapping for a medical data visualisation project.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; I&#39;m finding just compiling VTK on my linux box (ubuntu) to be<br>
&gt; much<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; more<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; difficult than i expect.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; So far i have install cmake and set various option and<br>
&gt; generated the<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; make<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; file.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; When I run the make file however i get:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; zoizoi@mangoNupheus:/usr/local/VTK$ make<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; [ &nbsp;0%] Built target vtkParseJava<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; [ &nbsp;0%] Built target vtkWrapJava<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; [ &nbsp;0%] Built target vtksys<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; [ &nbsp;0%] Building CXX object<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Common/CMakeFiles/vtkCommon.dir/vtkDataArraySelection.o<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; /usr/local/VTK/Common/vtkDataArraySelection.cxx:27: error: ISO<br>
&gt; C++<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; forbids<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; declaration of &#39;vector&#39; with no type<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; /usr/local/VTK/Common/vtkDataArraySelection.cxx:27: error:<br>
&gt; invalid<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; use of<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &#39;::&#39;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; /usr/local/VTK/Common/vtkDataArraySelection.cxx:27: error:<br>
&gt; expected<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &#39;;&#39;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; before &#39;&lt;&#39; token<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; ...and then a long long list of errors which it&#39;s probably not<br>
&gt; worth<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; posting. This is VTK 5.0.4<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; i have no idea what&#39;s causing this as my knowledge of C++ is<br>
&gt; pretty<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; limited. Is there some configure option i need to set to get the<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; compiler to<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; be less stringent or something?<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; hope someone can help as i need to get working on this project<br>
&gt; asap.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Liam<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
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