<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
<font size="-1"><font face="Verdana">Thanks a lot Anka,<br>
<br>
I tried setting the lookup table like this:<br>
<br>
vtkLookupTable *hueLut = vtkLookupTable::New();<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; hueLut-&gt;SetTableRange (0, 2000);<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; hueLut-&gt;SetHueRange (0, 1);<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; hueLut-&gt;SetSaturationRange (1, 1);<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; hueLut-&gt;SetValueRange (1, 1);<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; hueLut-&gt;Build();<br>
<br>
But it just gives the image a "goldish" tint which isnt what I want. I
am guessing I set up the table wrong?<br>
</font></font><br>
Anka Kochanowska wrote:
<blockquote cite="mid:49BE5D25.1030200@bic.mni.mcgill.ca" type="cite">SetLookupTable()
?
  <br>
Anka
  <br>
  <br>
John Eke wrote:
  <br>
  <blockquote type="cite"><br>
Hi,
    <br>
    <br>
I am currently calculating window-level values of an image actor from
user selected brightness and contrast levels. I pass these values to
vtkImageMapToWindowLevelColors::SetWindow and
vtkImageMapToWindowLevelColors::SetLevel methods. The brightness and
contrast works, but it always outputs a greyscale image. How can I get
it to do the window-level modifications and still output a color image?
(Just like in vtkImageViewer but I noticed it uses vtkImageMapper which
does vtkImageMapper::SetColorWindow - is there a difference?)
    <br>
    <br>
Am I not setting up my lookup table properly? Not sure what the problem
is.
    <br>
    <br>
Thanks
    <br>
    <br>
John E
    <br>
    <br>
    <br>
-----Original Message-----
    <br>
From: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:vtkusers-bounces@vtk.org">vtkusers-bounces@vtk.org</a> on behalf of Miguel Angel Rodriguez
Florido
    <br>
Sent: Mon 3/16/2009 9:13 AM
    <br>
To: Mathieu Malaterre
    <br>
Cc: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:vtkusers@vtk.org">vtkusers@vtk.org</a>
    <br>
Subject: Re: [vtkusers] vtkDICOMImageReader and an extrange error,..
    <br>
    <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Hi Mathieu,
    <br>
    <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; You were right. The dicom file was compressed. I have used the
gdcmconv
    <br>
cmd to uncompress it.
    <br>
    <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Thank you very much for your useful information.
    <br>
    <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Best.
    <br>
    <br>
Mathieu Malaterre wrote:
    <br>
&gt; Did you read the documentation ?
    <br>
&gt; <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.vtk.org/doc/nightly/html/classvtkDICOMImageReader.html">http://www.vtk.org/doc/nightly/html/classvtkDICOMImageReader.html</a>
    <br>
&gt;
    <br>
&gt; If you can read it with Slicer, this means this is a proper DICOM
file
    <br>
&gt; but vtkDICOMImageReader only handles:
    <br>
&gt;
    <br>
&gt; ...
    <br>
&gt; Warning:
    <br>
&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; This reader might eventually handle ACR-NEMA file (predecessor
of
    <br>
&gt; the DICOM format for medical images). This reader does not handle
    <br>
&gt; encapsulated format, only plain raw file are handled. This reader
also
    <br>
&gt; does not handle multi-frames DICOM datasets.
    <br>
&gt; ...
    <br>
&gt;
    <br>
&gt; Have a look at vtkGDCMImageReader which will handle you file (I
would
    <br>
&gt; bet this is a compressed data).
    <br>
&gt;
    <br>
&gt; <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://gdcm.sourceforge.net/html/classvtkGDCMImageReader.html">http://gdcm.sourceforge.net/html/classvtkGDCMImageReader.html</a>
    <br>
&gt;
    <br>
&gt; ref:
    <br>
&gt;
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://apps.sourceforge.net/mediawiki/gdcm/index.php?title=GDCM_Release_2.0">http://apps.sourceforge.net/mediawiki/gdcm/index.php?title=GDCM_Release_2.0</a>
    <br>
&gt;
    <br>
&gt; If you cannot integrate gdcm into your project you can use
gdcmconv
    <br>
&gt; --raw to decompress the image and make it compatible with
    <br>
&gt; vtkDICOMImageReader
    <br>
&gt;
    <br>
&gt;
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://apps.sourceforge.net/mediawiki/gdcm/index.php?title=Gdcmconv">http://apps.sourceforge.net/mediawiki/gdcm/index.php?title=Gdcmconv</a>
    <br>
&gt;
    <br>
&gt; 2cts
    <br>
    <br>
    <br>
--
    <br>
Miguel Angel Rodr&iacute;guez Florido
    <br>
Departamento de Ingenier&iacute;a del Software
    <br>
Divisi&oacute;n de Investigaci&oacute;n y Desarrollo Tecnol&oacute;gico
    <br>
INSTITUTO TECNOLOGICO DE CANARIAS, S.A. - GOBIERNO DE CANARIAS
    <br>
URL: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="http://www.itccanarias.org">www.itccanarias.org</a> Tlfno: +34 928 727548, Fax: +34 928 727517
    <br>
    <br>
--------------------------------------------------------------------------
    <br>
AVISO LEGAL:
    <br>
Este mensaje y los ficheros adjuntos si los hubiere, se dirigen
    <br>
exclusivamente a su destinatario y puede contener informaci&oacute;n
    <br>
privilegiada o confidencial. La transmisi&oacute;n err&oacute;nea del presente
mensaje
    <br>
en ning&uacute;n momento supone renuncia a su confidencialidad. Si no es vd.
el
    <br>
destinatario indicado, queda notificado de que la utilizaci&oacute;n,
    <br>
divulgaci&oacute;n y/o copia sin autorizaci&oacute;n est&aacute; prohibida en virtud de la
    <br>
legislaci&oacute;n vigente. Si ha recibido este mensaje por error, le rogamos
    <br>
que nos lo comunique inmediatamente por esta misma v&iacute;a y proceda a su
    <br>
destrucci&oacute;n.
    <br>
    <br>
LEGAL WARNING:
    <br>
This message and the files attached if there were any, are intended
    <br>
exclusively for its addressee and may contain information that is
    <br>
CONFIDENTIAL and protected by professional privilege. A wrong
    <br>
transmission to this message don't suppose we relinquished to It's
    <br>
confidential. If you are not the intended recipient you are hereby
    <br>
notified that any dissemination, copy or disclosure of this
    <br>
communication is strictly prohibited by law. If this message has been
    <br>
received in error, please immediately notify us via e-mail and delete
it.
    <br>
    <br>
    <br>
    <br>
    <br>
    <br>
    <br>
    <br>
    <br>
------------------------------------------------------------------------
    <br>
    <br>
_______________________________________________
    <br>
Powered by <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="http://www.kitware.com">www.kitware.com</a>
    <br>
    <br>
Visit other Kitware open-source projects at
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a>
    <br>
    <br>
Please keep messages on-topic and check the VTK FAQ at:
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ">http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ</a>
    <br>
    <br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:
    <br>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.vtk.org/mailman/listinfo/vtkusers">http://www.vtk.org/mailman/listinfo/vtkusers</a>
    <br>
&nbsp; </blockquote>
</blockquote>
<br>
<pre class="moz-signature" cols="72">-- 
INFORMAL COMMUNICATION - The statements within this email and attachments if any, may be founded on partial knowledge, incorrect information, or incomplete understanding of the issues and should not be accorded the probity or status of a formal evidentiary deposition.

 

CONFIDENTIALITY STATEMENT - This e-mail and  attachments if any, may contain confidential or privileged information. If you are not the intended recipient, please delete it, notify me immediately by reply e-mail, and be advised that you are not permitted to read, use, disclose, copy, or distribute it or its contents.
</pre>
</body>
</html>