
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">

<HTML><HEAD>

<META content=text/html;charset=iso-8859-1 http-equiv=Content-Type>

<META name=GENERATOR content="MSHTML 8.00.7600.16490"></HEAD>

<BODY style="PADDING-LEFT: 10px; PADDING-RIGHT: 10px; PADDING-TOP: 15px" 

id=MailContainerBody leftMargin=0 topMargin=0 CanvasTabStop="true" 

name="Compose message area">

<DIV><FONT face=Calibri>hi there,</FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Calibri></FONT>&nbsp;</DIV>

<DIV><FONT face=Calibri>i'm having some issues with volume rendering. my goal is 

to display a 3d model of 240 OCT slices with 511x427px. I've managed to create 

the 3d model using the vtkFixedPointVolumeRayCastMapper but the performance is 

just too slow. I read that this could be solved using the 

vtkVolumeTextureMapper2D that, if I understood correctly, would use GPU 

acceleration. Unfortunately, this renders nothing, only a black 

screen.&nbsp;Since i'm out of ideas I hope that someone could help me in this. 

I'm&nbsp;using the&nbsp;VTK .NET wrapper (hoping this is not whats causing the 

issue). </FONT></DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV><FONT face=Calibri>System config:</FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Calibri>Intel Pentium Dual CPU T3200</FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Calibri>4GB RAM</FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Calibri>NVIDIA GeForece 9300GS 256 MB</FONT></DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV><FONT face=Calibri>C# Code:</FONT></DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV><FONT 

face=Calibri>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

vtkRenderer renderer1 = new 

vtkRenderer();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

vtkRenderWindow renWin1 = new 

vtkRenderWindow();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

vtkOpenGLExtensionManager extensions = new 

vtkOpenGLExtensionManager();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

extensions.SetRenderWindow(renWin1);<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

extensions.Update();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

extensions.LoadExtension("GL_VERSION_2_0");<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

extensions.Dispose();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

renWin1.AddRenderer(renderer1);</FONT></DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV><FONT 

face=Calibri>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

vtkRenderWindowInteractor iren1 = new 

vtkRenderWindowInteractor();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

iren1.SetRenderWindow(renWin1);</FONT></DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV><FONT 

face=Calibri>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

vtkJPEGReader reader = new 

vtkJPEGReader();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

reader.SetFilePattern("C:\\Teste\\Crop\\%d.jpg");</FONT></DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV><FONT 

face=Calibri>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

reader.SetDataExtent(0, 511, 0, 427, 0, 

72);<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

reader.SetDataSpacing(10.7, 8, 20); // 

mm<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

reader.SetDataOrigin(0, 0, 

0);<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

//reader.SetNumberOfScalarComponents(1);<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

reader.SetDataScalarTypeToUnsignedChar();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

reader.Update();</FONT></DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV><FONT face=Calibri>

<DIV><BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

vtkPiecewiseFunction opacityTransferFunction = new 

vtkPiecewiseFunction();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

opacityTransferFunction.AddPoint(180, 

0.0);<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

opacityTransferFunction.AddPoint(0, 1);</DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

vtkVolumeProperty volumeProperty = new 

vtkVolumeProperty();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

volumeProperty.SetScalarOpacity(opacityTransferFunction);<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

volumeProperty.SetInterpolationTypeToNearest();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

//volumeProperty.ShadeOn();</DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

vtkVolumeTextureMapper2D textureMapper = new 

vtkVolumeTextureMapper2D();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

textureMapper.SetInputConnection(reader.GetOutputPort());<BR>&nbsp;<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

//vtkFixedPointVolumeRayCastMapper volumeMapper = new 

vtkFixedPointVolumeRayCastMapper();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

//volumeMapper.SetInputConnection(reader.GetOutputPort());</DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

vtkVolume volume = new 

vtkVolume();<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

volume.SetMapper(textureMapper);<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

volume.SetProperty(volumeProperty);<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

renderer1.AddVolume(volume);<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

renderer1.ResetCamera();</DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

renWin1.Render();</DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

iren1.Initialize();</DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV>Regards,</DIV>

<DIV>&nbsp;</DIV>

<DIV>Pedro</FONT>&nbsp;</DIV></BODY></HTML>